Projekt na wielką skalę renowacji rozpoczęto tutaj w roku 2001 i zakończono 3 lata później. Obecnie w muzeum wystawionych jest ponad 200 tysięcy eksponatów i jest ono miejscem, gdzie można zobaczyć drogocenne skamieniałości, w tym skamieniałość Sinornithosaurusa i największą i najlepiej zachowaną skamieniałość Hantungosaurus giganteusa, a także skamieniałości Człowieka Pekińskiego i Człowieka Yuanmou.
W muzeum znajduje się 5 sal. Sala Ziemi poświęcona jest, mającej 4,6 bilionów lat, historii Ziemi. Sala Życia Prehistorycznego pokazuje rozwój życia na Ziemi. W niej powstała przy użyciu supernowoczesnej technologii 5-metrowa skamieniałość Ichthyosauria, którą zwiedzający mogą dotknąć i która przywraca w muzeum do życia świat dinozaurów. Sala Kamieni Szlachetnych przedstawia drogocenne kamienie. Sala Terenów Lądowych i Zasobów dotyczy terenów lądowych, minerałów i zasobów morskich Chin.